tok2というサーバーに設置した方、パーミッションの変更の仕方（どれに変更すればいいのか）を教えてくれませんか？

小生もTok2プロ利用してます。
パーミッションはFFFTPとかのソフトもしくは
オンラインでのFTPを使って更新します。
FFFTPしか使ってないので、説明が簡単ですが
ファイルアップロードをした後に対象のファイルを選択して
右クリック→属性変更で
TOK2であればCGIファイルは「700」
読み込みの644ファイルなどは「600」
各それぞれのフォルダは「701」を設定しておけば動作します。